
Biotechnology leadership, Viral Vectors for Cell & Gene therapy | PhD from @UW @MCBSeattle @fredhutch |Virologist🦠Metalhead🤘Film Composer🎵Sailor⛵️Filmmaker🎥
Seattle & Istanbul
Joined December 2017
- Tweets21.8K
- Following1.9K
- Followers148K
- Likes33.2K
Pinned Tweet
Bilim ve Sanat ile iç içe olan hayat öykümü sağolsun @CepHikayeleri ele aldı.
YouTube’da “Notalar ve Virüsler”
youtu.be/l12dR76qwHU
Hepatit B virüsü için ilk defa bir tedavi mümkün olabilir. Bu hafta FDA hepatit B enfeksiyonu için yeni bir ilaç onayladı, ismi Hibsago (bepirovirsen).
Videoda açıklıyorum 👇
Selvi Boylum Al Yazmalım, Cahit Berkay. Barış Yekta Karatekeli yapımı ud ile, Türk sinemasının en güzel örneklerinden. Hüseynî makamında, uşşak ve segâh çeşnileri ile.
#turkishoud #filmmusic
Semih Tareen retweeted
Bilim , sabırdır
Semih de öyle
Kuyudaki taşı üşenmemiş çıkarmış
Safsata filan dememiş, birine anlatır gibi…
Bir virolog ve moleküler biyolog gözüyle değerlendirelim:
1. “Kök hücre çaldılar, bir milletin genetik yapısının haritası”
👉 Ne tür hücre olduğunu bilmiyoruz (embriyonik mi? Kordon mu? ipsc mi? somatik mi) ama birisine ait olduğunu varsayalım. Evet, bu hücrelerden genom sekanslaması yapılıp haritası çıkarılabilir.
👉 Peki ne bulurlar? Metoda göre biraz değişir (WGS mi İllumina mı) ama Kaynağı kim ise o kişinin genomu çıkar, ve o kişiye ait farklılıklar, mutasyonlar, tek nükleotid polimorfizmi (SNP) çıkar.
👉 Peki, belli bir millete ait özellikler olur mu? İşte burada konu karışıyor. Evet coğrafi kalıtsal sebeplerden dolayı bir de genetic drift dediğimiz genetik sürüklenmeden dolayı tek nükleotid seviyesinde SNP farklılıkları olabilir.
👉 Fakat, tek kişinin genomundan bütün bir millete uyarlama yapmak söz konusu değil çünkü belli bir millete özgü genetik bir sekans yok. Coğrafi dağılımlar var ve bunun sonucu ortaya çıkan genetik mozaik var. Hatta öyle ki, aynı bölgeden aynı milletten 2 kişinin genom haritasını çıkarın, birbirine %100 benzemeyecekler.
2. “Bir millete silah yapabilirler.”
👉 Bir milleti enfekte edecek, diğer milletleri enfekte etmeyecek herhangi bir biyolojik silah yapmak mümkün değil. Bunun bir sebebi yukarıda açıkladığım millet-içi genetik mozaik, yani belli “bir milletin genetik yapısı” diye bir şey yok, kendi içlerinde de değişik herkes.
👉 Varsayım yapalım: diyelim ki bütün bir millete ait ve sadece o millete özgü genetik bir yapı var, sadece bu milleti enfekte edecek bir virüs söz konusu olması için o virüs sadece ve sadece o milletin hücre yüzeyi reseptörüne bağlanacak, sadece o milletin hücrelerini enfekte edecek. Böyle bir durum biyolojik olarak mümkün değil. Ayrıca, mümkün varsayalım: virüsler en çabuk evrimleşen varlıklar, bu sebeple kısa zamanda o milletten çıkıp başka milletleri enfekte edebilir, yani insandan insana bulaşabilir ve belli bir milletle sınırlı kalmaz.
👉 İstisnalar var mı? Var: Örneğin, Avrupa’da bazı insanlarda CCR5 mutasyonu var. Bu mutasyon yüzünden (sayesinde) HIV kapamıyorlar çünkü hücre yüzeyindeki CCR5 reseptörüne HIV bağlanamıyor. Hatta kesin HIV tedavisinde bu insanlardan ilik nakli bu sebeple yapılır. Bu, belli bir nüfusun genetik farklılığı ve HIV gibi bir virüse duyarlılık farkı için güzel bir örnek. Ama bu CCR5 mutasyonu belli bir millete, belli bir ülke sınırlarına hatta belli bir etnik kökene ait değil. Tüm Avrupa’da farklı yüzdelerde görülen bir mutasyon. O yüzden bu bildiğimiz örnekte bile bir millete ait özel bir durum yok.
3. “Yüz binlerce yıldır insanlara bulaşmamış olan virüsler yarasadan, kuştan bulaşır mı?”
👉 Bal gibi bulaşır. Bunun örneğini defalarca gördük. Birkaçını sayayım: HIV hayvanlardan insanlara geçti, hem de en az 13 kez! Evet yanlış okumadınız. Bugünkü AIDS’e sebep HIV salgını bu 13 kez hayvandan insana geçişlerin bazılarının kalıcı olup insanlarda HIV haline gelmesi. HIV’in primatlardaki atası SIV milyonlarca sene öncesine gidiyor. Yani evet, yüzbinlerce değil milyonlarca sene öncesinden bir virüs insanlara geçip salgın yaratabilir. Hayvanlardan insanlara geçen patojen hastalıklara zoonosis diyoruz.
👉 Diğer örnekler: Koronavirüsler insanlara en az 7 kez hayvanlardan geçti. Bunlardan 4’ü endemik halde her sene soğuk algınlığı ve grip-benzeri hastalıklara sebep oluyor. Diğer 3’ü de bildiğimiz SARS, MERS ve Covid19 salgınları. Bunların hepsi ya yarasalardan insanlara geçti, ya da yarasa/kemirgen ile orta bir hayvandan (MERS’te deveden mesela) insanlara geçti.
👉 Son bir örnek: kızamık virüsü. Şu an insanlarda endemik, fakat kızamık virüsü hayvancılıkla yaklaşık 2500 sene önce insanlara geçti ve endemik hale geldi.
4. “Kimsesiz mahkumlarda denenen biyolojik silahlar” +
Semih Tareen retweeted
📍Son günlerde artan yağışlardan kaynaklı İstanbul ve başka pek çok yerde sel felaketleri yaşandı.
🗨Ne yazık ki, bu durum sel kaynaklı hastalık bulaşma riskini de ortaya çıkarıyor. Dr. Semih Tareen ile sel felaketinden sonra ortaya çıkabilecek hastalıkları konuştuk.
@virusfantom
🔗gazetebilim.com.tr/sel-felak…
Bir virolog ve moleküler biyolog gözüyle değerlendirelim:
1. “Kök hücre çaldılar, bir milletin genetik yapısının haritası”
👉 Ne tür hücre olduğunu bilmiyoruz (embriyonik mi? Kordon mu? ipsc mi? somatik mi) ama birisine ait olduğunu varsayalım. Evet, bu hücrelerden genom sekanslaması yapılıp haritası çıkarılabilir.
👉 Peki ne bulurlar? Metoda göre biraz değişir (WGS mi İllumina mı) ama Kaynağı kim ise o kişinin genomu çıkar, ve o kişiye ait farklılıklar, mutasyonlar, tek nükleotid polimorfizmi (SNP) çıkar.
👉 Peki, belli bir millete ait özellikler olur mu? İşte burada konu karışıyor. Evet coğrafi kalıtsal sebeplerden dolayı bir de genetic drift dediğimiz genetik sürüklenmeden dolayı tek nükleotid seviyesinde SNP farklılıkları olabilir.
👉 Fakat, tek kişinin genomundan bütün bir millete uyarlama yapmak söz konusu değil çünkü belli bir millete özgü genetik bir sekans yok. Coğrafi dağılımlar var ve bunun sonucu ortaya çıkan genetik mozaik var. Hatta öyle ki, aynı bölgeden aynı milletten 2 kişinin genom haritasını çıkarın, birbirine %100 benzemeyecekler.
2. “Bir millete silah yapabilirler.”
👉 Bir milleti enfekte edecek, diğer milletleri enfekte etmeyecek herhangi bir biyolojik silah yapmak mümkün değil. Bunun bir sebebi yukarıda açıkladığım millet-içi genetik mozaik, yani belli “bir milletin genetik yapısı” diye bir şey yok, kendi içlerinde de değişik herkes.
👉 Varsayım yapalım: diyelim ki bütün bir millete ait ve sadece o millete özgü genetik bir yapı var, sadece bu milleti enfekte edecek bir virüs söz konusu olması için o virüs sadece ve sadece o milletin hücre yüzeyi reseptörüne bağlanacak, sadece o milletin hücrelerini enfekte edecek. Böyle bir durum biyolojik olarak mümkün değil. Ayrıca, mümkün varsayalım: virüsler en çabuk evrimleşen varlıklar, bu sebeple kısa zamanda o milletten çıkıp başka milletleri enfekte edebilir, yani insandan insana bulaşabilir ve belli bir milletle sınırlı kalmaz.
👉 İstisnalar var mı? Var: Örneğin, Avrupa’da bazı insanlarda CCR5 mutasyonu var. Bu mutasyon yüzünden (sayesinde) HIV kapamıyorlar çünkü hücre yüzeyindeki CCR5 reseptörüne HIV bağlanamıyor. Hatta kesin HIV tedavisinde bu insanlardan ilik nakli bu sebeple yapılır. Bu, belli bir nüfusun genetik farklılığı ve HIV gibi bir virüse duyarlılık farkı için güzel bir örnek. Ama bu CCR5 mutasyonu belli bir millete, belli bir ülke sınırlarına hatta belli bir etnik kökene ait değil. Tüm Avrupa’da farklı yüzdelerde görülen bir mutasyon. O yüzden bu bildiğimiz örnekte bile bir millete ait özel bir durum yok.
3. “Yüz binlerce yıldır insanlara bulaşmamış olan virüsler yarasadan, kuştan bulaşır mı?”
👉 Bal gibi bulaşır. Bunun örneğini defalarca gördük. Birkaçını sayayım: HIV hayvanlardan insanlara geçti, hem de en az 13 kez! Evet yanlış okumadınız. Bugünkü AIDS’e sebep HIV salgını bu 13 kez hayvandan insana geçişlerin bazılarının kalıcı olup insanlarda HIV haline gelmesi. HIV’in primatlardaki atası SIV milyonlarca sene öncesine gidiyor. Yani evet, yüzbinlerce değil milyonlarca sene öncesinden bir virüs insanlara geçip salgın yaratabilir. Hayvanlardan insanlara geçen patojen hastalıklara zoonosis diyoruz.
👉 Diğer örnekler: Koronavirüsler insanlara en az 7 kez hayvanlardan geçti. Bunlardan 4’ü endemik halde her sene soğuk algınlığı ve grip-benzeri hastalıklara sebep oluyor. Diğer 3’ü de bildiğimiz SARS, MERS ve Covid19 salgınları. Bunların hepsi ya yarasalardan insanlara geçti, ya da yarasa/kemirgen ile orta bir hayvandan (MERS’te deveden mesela) insanlara geçti.
👉 Son bir örnek: kızamık virüsü. Şu an insanlarda endemik, fakat kızamık virüsü hayvancılıkla yaklaşık 2500 sene önce insanlara geçti ve endemik hale geldi.
4. “Kimsesiz mahkumlarda denenen biyolojik silahlar” +
TUSAŞ Motor Sanayii Genel Müdürü Akşit:
▬ Türkiye'den kök hücreleri çaldılar götürdüler, Türk milletinin genetik yapısının haritasını çıkarıyorlar.
▬ Sadece Türk milletine etki edecek silah yapabilirler. Teknolojiyi görüyorsunuz.
▬ Tedbir almamız lazım, bilim adamlarımızın olması lazım.
▬ Yüz binlerce yıldır insanlara bulaşmamış olan virüsler yarasadan, kuştan bulaşır mı? Bulaşmaz.
▬ Birileri o virüsü alıp laboratuvarda DNA'sı ile oynayarak modifiye ediyor, insan hücresine yapışacak hale getiriyor.
▬ Bir yerlerde kimsesiz mahkumların üzerinde deneyerek biyolojik silah olarak dolaba koyuyor.
4. “Kimsesiz mahkumlarda denenen biyolojik silahlar”
👉 Ne yazık ki bu insanlık tarihinin en karanlık örneklerinden. Mahkumlar olsun, akıl hastaları olsun, veya paraya muhtaçlar olsun, özellikle 18. 19. ve 20. yy’larda. Örneğin: 2. Dünya savaşında Japonya ve Almanya’da mahkum ve savaş tutukluları üzerindeki patojen deneyleri, ABD’de mahkum ve akıl hastalarında cinsel yolla bulaşan patojen deneyleri (en meşhuru Tuskagee syphilis deneyleri).
👉 Bunların dışında ne yazık ki tarihten bilinen biyolojik silah örnekler: Veba zamanında 14. yy’da savaş sırasında mancınık ile kale surları içine vebadan ölenlerin cesetlerinin atılması, 18. yy’da kızılderililere çiçek (smallpox) virüsü ile kuşanmış battaniyelerin verilmesi.
👉 Bunların hepsi ne yazık ki insanlığın kara lekesi.
4. “Kimsesiz mahkumlarda denenen biyolojik silahlar”
👉Ne yazık ki bu insanlık tarihinin en karanlık örneklerinden. Mahkumlar olsun, akıl hastaları olsun, veya paraya muhtaçlar olsun, özellikle 18. 19. ve 20. yy’larda. Örneğin: 2. Dünya savaşında Japonya ve Almanya’da mahkum ve savaş tutukluları üzerindeki patojen deneyleri, ABD’de mahkum ve akıl hastalarında cinsel yolla bulaşan patojen deneyleri (en meşhuru Tuskagee syphilis deneyleri).
👉Bunların dışında ne yazık ki tarihten bilinen biyolojik silah örnekler: Veba zamanında 14. yy’da savaş sırasında mancınık ile kale surları içine vebadan ölenlerin cesetlerinin atılması, 18. yy’da kızılderililere çiçek (smallpox) virüsü ile kuşanmış battaniyelerin verilmesi.
👉Bunların hepsi ne yazık ki insanlığın kara lekesi.
Semih Tareen retweeted
📍Nobel Tıp Ödülü hakkında tüm detaylar!
🗨Her yıl olduğu gibi bu yıl da Nobel Ödülleri sahiplerini buldu. Dr. Semih Tareen, GazeteBilim’e özel açıklamalarıyla Nobel Tıp Ödülü hakkında değerli bilgiler verdi.
@virusfantom
🔗gazetebilim.com.tr/nobel-tip…
Aynı video YouTube sayfamda da mevcut : youtube.com/shorts/wsZxnTykD…
2026 Nobel Kimya Ödülü “Asimetrik Organik Sentezinde otokataliz ve lineer olmayan etkilerin keşfi” için Kagan ve Soai’ye verildi. Peki bu ne demek ve neden önemli? Anlatıyorum.
Urartu hocamızdan genç arkadaşlara harika bir nasihat
Aman Allahım o da ne, bu sene Tıp ve Fizyoloji Nobel ödülüne layık görülen Georg Nagel'in h-index'i (WoS) sadece 34, inanılmaz! Bu kadar "değerli ve ÇOOOK önemli" bir metrikte bu kadar düşük değere sahip olan birisi nasıl Nobel almış!!!
Genç arkadaşlar, h-index tek başına sadece çöptür. Önemli olan meraktır, merakının peşinden gitmektir. Doğa muhteşem mekanizmalarla dolu, onların sırlarını çözmek ve insanlığa kazandırmak için emek ve zaman ayırmak en değerli akademik faaliyettir. Zaten, bu işlerle uğraşırken makale bir sonuç olarak ortaya çıkar! Bir fikrin, merakın hedefini "makale basmak" "atıf almak" "yüksek h-index edinmek" olarak koymak takdir edilecek bir şey değildir!
Akademik sistem tamamen çürüyüp, çöktüğünde bu anlamsız baskı da ortadan kalkacak.
Optogenetik tıpta nasıl uygulanır?
👉Retinitis Pigmentosa isimli genetik körlükte tedavi olarak klinik çalışmalarda kullanılıyor. RP ile gözde ışık alıp beyne sinyal veren hücreler ölü. Yeşil algden alınan OPSİN geni virüs kullanarak gözdeki dokulara aktarılıyor ve ışığa duyarlı hale getirilerek körlük kısmen olsa da iyileştiriliyor.
👉Gelecekte ümit vadettiği çok konu olsa da özellikle kardiyolojide kalp pili kullanımında optogenetik sahası çok ilginç olacak: Günümüzdeki kablo ile elektrik veren kaba cihazlar yerine mikro seviyede kablosuz tamamen ışık ile çalışarak kalbin sadece bir kaç hücresine seçici bir şekilde ışık-elektrik sinyalini oluşturabilmek.
1 saatten az kaldı. TSİ 12:30 gibi Nobel Tıp ödülü canlı yayında açıklanacak. Yayını izlemek isteyenler: youtube.com/live/wUzEYfTLW6c…
Semih Tareen retweeted
Ne güzel özetlemiş
Süreç olarak bilimin sonuçları, sonrasında sonuçların süreçleri
İnsanın akıllı türevini ve haliyle bilimi seviyorum
İlk ikisi çok yaygınlaşacak
Birincisini kendime de başladım
Üç hafta oldu
Bakalım yarın Semih’in tahminleri ödülle denkleşecek mi?










