Professor at UTokyo. (postdoc @Stanford) / b.1986 / structural biology, protein engineering, rhodopsin, GPCR https://xitter.cf/t.co/6mkl7Vi4qN

Joined November 2009
先日bioRxivにuploadしたこちらの論文が、(データを足した上で)NSMB誌にpublishされました。 nature.com/articles/s41594-0… あらためてこちらの論文の内容を簡単に紹介すると、「特に阻害剤が結合したGPCRのcryo-EM構造解析を簡単に行うための手法を開発したよ」というものです。
Replying to @emeKato
We present NOAH-ARK: combining de novo marker design ARK1 with in silico linker optimization program NOAH enables semi-automated, high-resolution GPCR structures—clear enough to resolve ligands, waters, and ions. (2/2)
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Hideaki E. Kato retweeted
Yoon Seok Kim, professeur assistant à l’EPFL a fait ses armes auprès de Thomas Südhof, de Brian Kobilka, puis de Karl Deisseroth, lauréat 2026 du Nobel en physiologie ou médecine. Retour sur un parcours hors du commun. actu.epfl.ch/news/yoon-seok-…
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嬉しいお知らせでした。 しかし自分の名前、日本語表記でミドルネームっぽく書かれると違和感がすごいですね。。笑
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羽田の入国システム、そこそこの頻度で使っているはずなのに、今回また色々と進化していて少し驚いた。
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(ようやく帰れる。お腹がすいた。。)
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おおおー
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21st international conference on retinal proteins (ICRP2026) で、研究員の但馬さんと博士3年の中村さんがposter prizeを受賞しました。Congratulations!
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逆に言えば,教員は話聞くときにメモ帳を取り出し,午後から毎日ラボに顔を出して「最近こうなんすよ~」って巡回中の教員に雑談的な報告をしてくれればたぶんものすごく喜びます.
学生20人指導していると,話しても忘れる/無視される,誠実に報告と相談をしない,来ない,あたりは積み重なって大きなストレスと時間損失になるので,しんどく思っています.
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恒例の論文祝いですが、今回はアステリスクがお休みだったのでビヤンネートルになりました。(そしてケーキは輸送時&切り分けの際に崩れました。。) いずれにせよ、小島くん、川上くん、小林くん、あらためておめでとう!
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Hideaki E. Kato retweeted
[プレスリリース] 薬剤が結合した受容体の立体構造を迅速かつ高精度に決定する手法を開発――AIと人工設計タンパク質を用いた汎用的なGPCR構造解析パイプラインを構築―――先端科学技術研究センター u-tokyo.ac.jp/focus/ja/press…
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ラボの学生さんのPC上でマウスが勝手に動いてグラフを作成していたので話を聞いてみたところ、Codexを使って殆どのデータ解析を自動化していた。マウスの動きが時々干渉するので2台目のPCが欲しいと言われ勿論即了承したのだが、Codexの使い方で完全に負けていたのでキャッチアップを頑張ろうと思った.
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Claude teamも了承されたので、これを機にラボ全体のCodex, Claudeの利用レベルを底上げしていきたい。
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今回の論文、個人的にはかなり気に入っていて、特にAlphaFoldによる構造予測だけじゃ不十分だよということをクリアに示したFig1cとSupFig2や、BRILよりARK1が良いことを示したFig4fとFig5fがお気に入りです。
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あとSup Fig.2も。
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