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Tomoki MOTEGI🧬

@MotegiTomoki

臨床獣医師（神経・内分泌・泌尿器・感染症）で、かつ病気（がん・免疫）の遺伝要因と祖先の関連解析の研究者 並列処理・機械学習・大規模化が得意 PhD (Vet)、DVM、ICD ※発言は所属と無関係です

 TUAT←BUMS🇺🇸←UT-VMC←RIKEN-IMS
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Joined March 2021
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【臨床感染症に特化した自著、発売開始！】 写真無いの？と言われたので、緑書房さんのご厚意でちょい見せです✨ 僕が相談を受けた疾患を中心に、可能な限り文献情報を盛り込みました✌ JCVIMでも緑書房さんのブースにありますので、ぜひ立ち読みしてみてください☺
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これで進んでくれれば良いけど、昨日思いついた解析は僕がHTANで作ったシステムを超えるものは無かったので、やはりまだ生きていけるのを確認した（笑） フェレットとかも上手くいきそうだし、まだまだやれます🐣
ひよこ🐣 (@bio_labcode) profile pictureひよこ🐣@bio_labcodeNov 8
AI時代のバイオインフォマティシャンの生き残り戦略知りたい。だってもうみんなsalmonとかDEseq2とか意識してなくて、もうAIで直接エンリッチメント解析とかボルケーノプロットまで出してもらってるでしょ？MLの予測精度の改善とかloop回して自動化してるでしょ？
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犬もUniveral Blockersで良いんだ👀 驚き😳
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ついにメチル化も動き始めた🙆‍♀️ 確かにプロモーター領域はHMMで調べるものがないけど、メチル化と組み合わせたらいけるかも？ Primerの自動化もできたし、WESも進行中。 今年度中に作らないといけないパイプラインは大体完了するかも？
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Single-cellでsignature解析をする際に、どれを使うか悩むので、surveyした論文を見つけた。 結局どの手法でも良いと思うのだけど、Bulk RNA-seqをベースとしたものはきちんと限界を知っておいた方が良いよねという話。 academic.oup.com/nargab/arti…
Comparative analysis of single-cell pathway scoring methods and a novel approach

Comparative analysis of single-cell pathway scoring methods and a novel approach

Abstract. Single-cell gene set analysis (scGSA) provides a useful approach for quantifying molecular functions and pathways in high-throughput transcriptom

academic.oup.com
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エアバスとボーイングにおけるTCAS思想の違いみたいな事故のイメージ🤔
Dr. KID (@Dr_KID_) profile pictureDr. KID
@Dr_KID_Nov 3
スペインで10月28日、高速列車同士が衝突し69人が死亡。1月にも46人が死亡する事故が発生していた。今回の事故直前には旧式信号システムが故障し、複数の列車が停止。その後、運行再開の指示を受けた列車が前方の列車に追突した。事故原因の詳しい調査が続く。 news.yahoo.co.jp/articles/35…
スペイン高速鉄道「1年に2度も大事故」の異常事態 信号システムトラブルは「ほぼ2日に1回」発生（東洋経済オンライン） - Yahoo!ニュース

スペイン高速鉄道「1年に2度も大事故」の異常事態　信号システムトラブルは「ほぼ2日に1回」発生（東洋経済オンライン） - Yahoo!ニュース

2026年10月28日、スペインの首都マドリードとセビリア間を結ぶ高速鉄道で列車同士が衝突する事故が発生、11月3日時点で死者数は69人にのぼる大惨事となった。スペインでは今年1月18日、南部コルド

news.yahoo.co.jp
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サンプルが間違えてるかもというミーティングは非常にストレスフルだったけど、無事終了ー🙆‍♀️
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Manuscript submission completed! だらだらしてしまったので確認から5か月も過ぎていました💦 後はscRNA-seqの解析を終える。 こちらも非常に解析カロリーが高い;つД｀)
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超音波でスイスチーズ様構造って所見名の意味が変わっちゃう😂
Kentaro Hara (@xharaken) profile pictureKentaro Hara@xharakenOct 30
現代になってスイスのチーズ（エメンタールチーズ）の穴が消え始めた話。この穴はチーズが発酵するときの炭酸ガスが「核」に集まって膨らんだものなんですが、実はこの「核」の役割を果たしていたのが、昔ながらの牛舎で搾乳中に混ざり込んだ空気中の微小な干草の粉塵であることが2015年に特定された。
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Fca126ってミトコンドリア情報が無いんだ😳 気づかなかったよ😅
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ということでリファレンス作成からやり直し(´･ωゞ) 非モデル故のトラップですねー
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平均生存日数が12889日は長すぎだろう🤣 ※多分1289日の誤植
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ボスの返事を待ってsubmit_(┐「ε:)_ 年内は後2報が確定したので、学生の尻を叩かねば苦笑
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これはすごく感じた。 うちのラボにも色々来てたけど、中には姉妹誌一報持ってても断られてたし。 うちはまず、人が雇える位お金稼がないと苦笑
Toshi (@toshiuscardio) profile pictureToshi
@toshiuscardioOct 25
有名PIより独立したての若手PIの先生の方がポスドク採用に慎重ですよね。限られた時間と予算の中で成果を出して次のグラントを勝ち取らないといけないから。採用する側からしたら、1人/50人が機能しないのと、1人/5人が機能しないのではラボに与える影響が違いすぎる。
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統計のやりすぎで目がしぱしぱする(´･ωゞ)
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ということで、お仕事🙆‍♀️
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そんなわけで無事に奈良に到着🙆‍♀️
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【奈良駅来れる人募集（笑）】 まず望みの無い募集をしてみてます🤣 20:00位から飲みたい人がいれば🤤
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エクストリーム学会準備ε≡≡ﾍ( ´Д`)ﾉ 流石に印刷15分前に解析終了は最高記録だ（笑）
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日向ぼっこ
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うちのボス凄いな、U01か☺ ※僕のプロジェクトは前立腺癌なので恩恵は無い(笑) bioengineer.org/nih-backs-bo…
NIH Backs Boston University Team Building Biomarkers to Catch Lung Cancer

NIH Backs Boston University Team Building Biomarkers to Catch Lung Cancer

A five-year, $3.4 million National Cancer Institute grant will help a Boston University-led consortium translate the Lung Pre-Cancer Atlas into biomarkers that distinguish dangerous lung ground glass...

bioengineer.org
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