@KomabaLab

東大市橋研のニュース等を流します

Joined January 2019
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M1の高槻さんが日本RNA学会年会 優秀賞を受賞しました。おめでとうございます！
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櫻井・庄司・市橋でやった論文が出ました。ドロプレット内反応を2段階で行うことで、翻訳タンパク質の完全in vitro進化ができるようになりました。WTより比活性の高いEF-Gも作れました pubs.acs.org/asbcd6/article/…

A Two-step Gene Expression Method for In Vitro Evolution of Translational Proteins

Abstract. Improving the reconstituted translation system is a key requirement for bottom-up synthetic biology. Here, we developed a two-step in vitro evolu

pubs.acs.org
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特任助教の公募を出しました。予算の確定状況の都合上、任期は2028年3月ということになっているのですが、別の契約で雇用は継続できる可能性があります。 人工細胞作りたい人とか進化させたいひとは、ご検討ください！　質問はダイレクトメッセージか、メールでどうぞ c.u-tokyo.ac.jp/info/news/em…
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昨年度まで特任助教でいらっしゃった金井さんの論文がでました。寄生型RNAがたくさんいる条件とあまりいない条件での進化を比較したところ、予想に反して寄生型RNAがいない方が多様性が高くなりました。academic.oup.com/mbe/advance…

Parasites constrain within-population diversification while accelerating between-population...

Abstract. Diversification of replicators from simple self-replicating RNA molecules is a major challenge in prebiotic evolution. In our previous evolution

academic.oup.com
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ただ、そもそもどの条件でも前の進化系列のようなRNA系統の大きな分岐が起きなかったので、RNAが複数系統に分岐して共存するためには何か別の要因が必要そうです。
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この前卒業した宮地さんの最後の論文がでました。 In vitroでアミノ酸(A, L, S)の配置を色々変えた非標準遺伝暗号表を10種類作って、変異に対する頑強性を調べたところ、どれもあまり変わりませんでした。 elifesciences.org/reviewed-p… プレスリリースもしました。 c.u-tokyo.ac.jp/info/news/to…
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この前卒業したD3湯川さんの論文がオープンになりました。プレスリリースもしました。自己複製RNAを高頻度希釈環境で長期継代したら、絶滅へ向かう進化がおきました。進化すればいいってものではないようです。 c.u-tokyo.ac.jp/info/news/to… academic.oup.com/mbe/article…
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この前卒業した宮地さんのtRNA array法version 2の論文が出ました。以前、報告した一気に21種類のtRNAを合成する方法を改良して、複数のタンパク質の発現量を個別にin vitro調整したtRNAを使ったときと同レベルまで上げました。以下のリンクから50日は無料で読めるそうです。authors.elsevier.com/a/1m%7E…
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次回4月5日（日）のNHKサイエンスゼロで、私たちの研究を紹介してもらえるようです。多分、市橋が登場します。web.nhk/tv/an/zero/pl/series…

生命とは何か?40億年の謎に挑む | サイエンスZERO

【NHK】生命とは何か?40億年の謎に挑む!▼生命を知るために研究者が「人工生命」を生んだ!?明らかになった「生命の定義」とは?▼生命誕生を再現?!非生命から生命はどうやって生まれたのか?▼40億年前の共通祖先とはどんな生命?そこから見えてきた「生命誕生のシナリオ」とは?▼生命科学から哲学へ、最新研究から生まれた研究者たちの「新たな生命観」

web.nhk
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今日から開催の生命の起源とアストロバイオロジー学会で2名が発表します。 S2-O6： 植田 悠斗　進化実験における自己複製 RNA と寄生型 RNA の融合 P-2A： 山本 風路　自己複製RNA の進化実験における組み換え体の出現
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学部4年の高槻さんが卒業されました。さらに一高賞も授与されました。おめでとうございます！
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今年は4名が修士の学位を取得しました。渡邊さん、櫻井さん、植田さん、折居さん、おめでとうございます！　うち2名（櫻井さん、植田さん）は研究奨励賞も受賞しました！
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宮地さんが博士の学位を取得しました。おめでとうございます！　恒例のこまっけろをプレゼントしました。
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特任助教の金井さんが「ゲノム微生物学会若手賞」、B4の高槻さんが「ゲノム微生物学会最優秀ポスター賞」を受賞しました。おめでとうございます！
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もうすぐ卒業する宮地さんの論文をbioRxivに上げました。in vitroで遺伝暗号表をできるだけ変えまくって、変異に対する頑強性を比較したところ、全然変わりませんでした。 biorxiv.org/content/10.64898…
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M1の山本風路さんが、先日行われたMASSIV 1.0 においてTop Poster Awardを受賞しました！　おめでとうございます。program.massivconference.com…

MASSIV Program

program.massivconference.com
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宮地さんの論文をbioRxivにあげました。昨年に発表した21種類のtRNAを全部一度に作る方法(tRNA array method)を改良して、複数のタンパク質について個別精製されたtRNAと同レベルの翻訳活性を達成しました。biorxiv.org/content/10.64898…

Enhanced tRNA array method version 2 for simultaneous in vitro synthesis of 21 tRNAs

Transfer RNAs (tRNAs) play an essential role in translation, and their simultaneous in vitro synthesis remains a key challenge in bottom-up synthetic biology. We previously developed the tRNA array...

biorxiv.org
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分子生物学会で金井さんと宮地さんが発表します（した）。 金井さん　[2P-171]自己複製RNAの進化実験における寄生種と分子種の多様化の関係 宮地さん　[3P-002]tRNA array法による21種類のtRNAのin vitro同時発現
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あと市橋もTwistのランチョンセミナーに出現します [3BT-03-01]自分で自分を作る（増殖する）分子システムの実現に向けて現状と課題
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D3の宮地さんがCREST領域会議で最優秀ポスター発表賞をもらってました。すごい！
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