@Doi_Lab

Biosphere Informatics Lab., Kyoto University, Japan. We are interested in ecology and environmental science using informatics.

 Kyoto, Japan
hideyuki-doi.github.io/
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We published a new paper in PNAS to define the Anthropocene onset using anthropogenic fingerprints in global geological archives. We found that the number of anthropogenic fingerprints began to increase abruptly from 1952 ± 3 CE. pnas.org/doi/10.1073/pnas.23…

Toward defining the Anthropocene onset using a rapid increase in anthropogenic fingerprints in...

One of the remaining issues regarding the Anthropocene is the lack of stratigraphic evidence indicating when the cumulative human pressure from the...

pnas.org
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Mebuki Ito@Hyla_tanukiOct 6
日本で初となる網羅的なマダニの全国分布図を作成した論文がParasites & Vectorsからpublishされました！ doi.org/10.1186/s13071-026-0… ダニ媒介性感染症の発生はベクターであるマダニの分布に大きく左右されると考えられますが、本邦には全国規模でマダニの分布を調べた研究がありませんでした

Predicting the distribution of 16 tick species in Japan and its association with the occurrence of...

Parasites & Vectors - Tick-borne diseases are a significant public health threat. Since the infection risk is directly associated with spatial variations of vector ticks, comprehensive data on...

link.springer.com
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Press release in Japanese: 日本の地球観測衛星GCOM-C「しきさい」のデータから得られる全懸濁物質量を用いて、相模湾と駿河湾を対象に解析し、沿岸域のブルーカーボン分布を広域的に把握できる可能性を検証しました。
京都大学@univkyotoSep 11
地球観測衛星しきさいから沿岸域の「ブルーカーボン」を広域的に把握する新たな可能性―相模湾・駿河湾で衛星観測による懸濁物質量と河川・海草藻場との関係を確認― kyoto-u.ac.jp/ja/research-ne…

地球観測衛星しきさいから沿岸域の「ブルーカーボン」を広域的に把握する新たな可能性―相模湾・駿河湾で衛星観測による懸濁物質量と河川・海草藻場との関係を確認―

研究者情報研究者名土居 秀幸

kyoto-u.ac.jp
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We published a case-study paper to evaluate satellite-based total suspended matter as a potential indicator of coastal blue carbon. 地球観測衛星　GCOM-C しきさい　による懸濁物質量から沿岸域のブルーカーボンを広域的に把握する新たな可能性を示しました。 sciencedirect.com/science/ar…
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国土交通省
@MLIT_JAPANSep 9
🫧・゜゜・。。・・ 　#ブルーカーボン 　ロゴマーク決定 ・゜゜・。。・・🌿 海の植物などが 吸収・貯留するCO2を指す 「ブルーカーボン」の取組を より多くの方に知っていただくため 新たにロゴマークを決定しました イベントやSNS 広報資料などで活用します mlit.go.jp/report/press/port… #アマモ
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Shunsuke Matsuoka@Mtok_SnskSep 6
論文が公開されました！ 10kmほどの範囲の森林景観において空気中の菌類の時空間動態を調べたところ、群集は季節や植生によって変化しており、近い場所(数十メートル)でも共通種が少なそう(分散制限が強いかも？)ということが明らかになりました。 論文DOI: doi.org/10.1016/j.funeco.202…
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Tomohiro Kuwae@tomohirokuwaeSep 2
Our paper on Japan’s J-Blue Credit scheme has now been published. Using real-world data from 61 blue carbon projects and 471 transactions, we examined what companies value when buying credits and how project features affect market outcomes. Open access: nature.com/articles/s44183-0…

Empirical analysis of project–purchaser dynamics in Japan’s blue carbon dioxide removal credit...

npj Ocean Sustainability - Empirical analysis of project–purchaser dynamics in Japan’s blue carbon dioxide removal credit scheme

nature.com
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Tomohiro Kuwae@tomohirokuwaeSep 2
ブルーカーボンクレジット（J-Blue Credit）の61プロジェクト、471件の取引を解析し、「企業は何を重視して購入したか」や「脱炭素以外の便益や地域性が価格や購入者数にどう影響したか」について、実際の取引データから実証的に示しました。論文は無料で閲覧可です！ nature.com/articles/s44183-0…

Empirical analysis of project–purchaser dynamics in Japan’s blue carbon dioxide removal credit...

npj Ocean Sustainability - Empirical analysis of project–purchaser dynamics in Japan’s blue carbon dioxide removal credit scheme

nature.com
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きたざわ@Ficedula_elisaeAug 27
大学の研究生活をかけて取り組んだ研究が(卒業後4年かけて)PNAS誌に掲載されました。 生物多様性への耕作放棄影響は地域や季節によって大きく異なるのですが、それを説明する概念モデルを提案し、九州から北海道にかけて全国約1200回の野外調査と世界規模のメタ解析から実証しました！
国立環境研究所
@NIES_JPAug 27
耕作放棄は生物多様性にとって正か負か？ ‐全国野外調査と全球メタ解析で保全上の価値を予測‐: 農村地域の人口減少は、日本を含む世界各地で進行しています。他国より一足先に人口減少が進む日本では、管理を続けられず、耕作が放棄された農地が増えています。 nies.go.jp/pr/news-and-updat…

耕作放棄は生物多様性にとって正か負か？ —全国野外調査と全球メタ解析で保全上の価値を予測— ｜2026年度｜国立環境研究所

農村地域の人口減少は、日本を含む世界各地で進行しています。他国より一足先に人口減少が進む日本では、管理を続けられず、耕作が放棄された農地が増えています。

nies.go.jp
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Tomohiro Kuwae@tomohirokuwaeJul 23
「炭素市場って本当に意味があるのか」。そう思っている人は少なくないと思います。私は、その答えは「制度をどう設計するか」にあると思います。審査基準の厳しさだけでは十分ではない。監督、情報公開、責任のあり方も含め、信頼され社会に受け入れられる制度設計とは何か。 journals.plos.org/climate/ar…

Eligibility interpreted as assurance and trust inflation in carbon credit markets

Carbon credit markets rely on eligibility rules to define which units may be used for compliance, procurement, or publicly endorsed claims. Yet eligibility designations may come to be interpreted as...

journals.plos.org
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Yusuke Onoda@yskondJul 8
森は長い時間をかけて育まれます。若い森では熾烈な光競争によって多くの木が枯れますが、成熟した森では多様な樹種が共存しています。私たちの研究は、この「競争の森」から「共存の森」への変化を、統一した理論で説明できることを示しました。kyoto-u.ac.jp/ja/research-ne…

森の木々の熾烈な競争と共存の謎を解く―なぜ巨木が独占せず、多様な木々と共存できるのか？―

研究者情報研究者名小野田 雄介

kyoto-u.ac.jp
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Mayϵ( 'Θ' )϶@SatsukiTsujiJun 16
📢プレプリで出していた「long-eDNAフクドジョウ系統地理」論文が正式公開されました！有難いことにOAです🎊 水試料からミトコン約1000bp複数領域を同時増幅し、詳細な系統地理推定+分岐年代推定まで出来ちゃう手法を開発しました！という内容です☺️ ちなみに→ mbmg.pensoft.net/article/177…

A practical and cost-effective approach to long-fragment eDNA sequencing for high-resolution...

Environmental DNA (eDNA) analysis is increasingly recognised as a valuable method for assessing genetic diversity. However, its resolution and applicability are limited by the short length of...

mbmg.pensoft.net
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Tomohiro Kuwae@tomohirokuwaeMay 26
ようやくブルーカーボンがなぜ炭素除去として機能するコアの部分、「難分解性有機物」が海藻や海草によってどのくらい生産されているかについての論文が出版されました。日本のブルーカーボンによる二酸化炭素吸収量やＪブルークレジット算定の根拠としているものです！　nature.com/articles/s43247-0…
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Shunsuke Matsuoka@Mtok_SnskMay 22
全国の大学生の皆様。 京大フィールド研では全国の大学生が参加できる公開実習を行っており参加者を募集中です！ フィールドに飛び込むことで、人と自然のつながりを見つめ、これからの社会のあり方を考えます。ユニークな実習なのでぜひ参加をご検討ください。参加者同士も仲良くなります。
K. Kobayashi@kobakaz_jpMay 21
こちらの実習で今年も他大学からの受講生を受け付けています。まもなく単位認定を伴う実習参加の締め切りとなりますので、ご希望の方はお早めにお手続きをお願いします。 京大の研究林試験地で開催している公開実習の詳細は以下のサイトをご覧ください。 fserc.kyoto-u.ac.jp/wp/akh/
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3年間の特定研究員もしくは特定助教を募集しています。早くて７月以後採用になります（採用時期は、年度内であれば応相談できます。）。生物多様性データなどの時系列解析、群集解析などの研究です。ご興味あれば、DMやメールでお問い合わせください。
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Mayϵ( 'Θ' )϶@SatsukiTsujiMay 21
📢論文＆プレリリでました～！ 特定外来生物のトカゲ、グリーンアノールを葉上に残された #環境DNA を用いて検出する手法を開発したよ、という内容です🦎🌴 自然研さん＆環境省さんとの初コラボ。感謝！ PDFご希望の方はDMでお気軽にどうぞ link.springer.com/article/10…

Developing terrestrial environmental DNA sampling methods for detecting arboreal invasive reptiles:...

Biological Invasions - Early detection of invasive alien species is essential for preventing establishment and mitigating ecological impacts, particularly in island ecosystems harbouring...

link.springer.com
京都大学@univkyotoMay 21
小笠原諸島で樹上性外来トカゲの痕跡を探る―葉面環境DNAのふき取りで高感度に侵入検知― kyoto-u.ac.jp/ja/research-ne…

小笠原諸島で樹上性外来トカゲの痕跡を探る―葉面環境DNAのふき取りで高感度に侵入検知―

外来生物の早期発見や侵入モニタリングは、定着を防ぎ、生態系への影響を軽減するために重要です。しかし、特に樹上性の爬虫類などは捕獲や目視による生息確認が困難であり、簡便かつ効率的な検知手法の開発が喫緊の課題とされていました。小笠原諸島などで深刻な生態系被害をもたらしている特定外来生物のグリーンアノールは樹上性の小型トカゲ類であり、まさにこうした確認が困難な種の典型例と言えます。 辻冴月...

kyoto-u.ac.jp
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New in @PNASNews : Ecological stability through nonlinear fluctuations and the portfolio effect We show that nonlinear dynamics like oscillations and chaos are paradoxically key to stabilizing important salmon regions in the Fraser River and Bristol Bay doi.org/10.1073/pnas.2535296…

Ecological stability through nonlinear fluctuations and the portfolio effect | PNAS

Much ecological theory has pursued understanding the mechanisms that stabilize communities, yet empirical analyses reveal deterministic nonlinear d...

pnas.org
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A new review paper led by Kenta Suzuki was published in Biological Reviews: "Advances in causal discovery methods for ecological time series" doi.org/10.1002/brv.70180

Advances in causal discovery methods for ecological time series

Recent advances in data collection technologies (e.g. automated sensor networks, satellite remote sensing, and high-throughput sequencing) have greatly expanded the availability of ecological time...

onlinelibrary.wiley.com
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AkiraSMori@AkiraSMoriMay 6
論文出版されました。前回の論文から10年以上を経て理論の更新：nature.com/articles/s41586-0… 生態系の安定性を時間的安定性、レジリアンス、抵抗性と回復力から評価し予測する。

Predicting temporal stability and resilience from resistance and recovery

Nature - New predictions for how temporal stability and resilience depend on their resistance and recovery components are explored.

nature.com
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日本生態学会@esjofficeApr 30
📢日浦会長メッセージ「コンテンツ・クレデンシャル」を掲載しました。 📸今回から会長撮影の写真を掲載しています（メッセージと関連はありません）。 esj.ne.jp/esj/message/10hiur…
河津の天然スギとアカガシなど常緑広葉樹の混交林

ALT 河津の天然スギとアカガシなど常緑広葉樹の混交林

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ポケモンが原点の生態学者、音で探る自然の再起　分野を繋ぐ「共通言語」が地球を救う globe.asahi.com/article/1650…

ポケモンが原点の生態学者、音で探る自然の再起　分野を繋ぐ「共通言語」が地球を救う：朝日新聞GLOBE＋

質の高い論文の割合で東京大を超え、世界9位となった沖縄科学技術大学院大学（OIST）。そこに集う世界各国の科学者たちは異能の人ばかり。そんな彼らを紹介するコラム「美ら島の国境なき科学者たち」は随時掲載します。

globe.asahi.com
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